漕运卫所废弛，可借机整治，为日后整顿卫所积累经验。接着说山东两府官员一案，牵扯众多，当由厂卫接手善后。再说孔家的事情，还是要礼部派一个老成持重的官员下来主持，地方处置名不正言不顺，还是扛着君父的名义下来的官员比较有说服力。具体到钱粮，山东地方可以担负。最后说到官员，吏部兵部，应尽快选派官员下来接任。
这份奏折到了京师，陈燮再次受到了百官的好评。之前那些弹劾陈燮的家伙，突然换了一张嘴脸，往死里夸陈燮。朱由检这一次很干脆的照准了陈燮的意思，不过加了一条，卫所整顿之事，由陈燮负责。具体到卫所官员的问题，由陈燮推荐至兵部。
兜了一个大圈子，最后给了陈燮这么一个好处，还是看在陈燮带兵厉害的面子上。朱由检小气吧啦的一面，暴露无遗了。陈燮兜了一圈，要的不就是这个么？接着旱情的机会，山东官场上下，都给收拾了一顿。两个府的官员，基本上都被装了进去。关键是卫所的权利，陈燮拿到手了，这一下整条运河，都在陈燮的手上。
在卫所这个问题上，朱由检和陈燮之间，其实是一个默契的结果。陈燮惦记要在运河上收费呢，这个事情朱由检可是记的很清楚的，不然也不能把卫所的事情都给陈燮处理。皇帝再信任一个官员，也都是有度的。
山东的事情到了这个地步，就算是基本结束了。皇帝的同意之后，陈燮立刻着手整顿山东卫所。本来还有个南直隶的大河卫，陈燮是在是够不着。卫所有大量的土地在军官的手里，这一次陈燮接着这个机会，上上下下的军官都撸了个干净。土地自然到手，由专人打理。军户还是军户，不过不用再当兵了，安心种田，地租降到三成五。负责农业这一块的负责人，带着军户修水利，挖深井，费用都是从罚没的钱财里出来。
一番梳理折腾下来，山东运河沿岸尽数落到陈燮手里。沿途的百户巡检等等官员，全部都换上登州营的军官，任城卫平山卫的官兵，也都换成了山东的新兵。
内阁来了个
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